chip cambios de A H1N1

Capta nuevo chip cambios de A H1N1

Una tecnología única desarrollada por científicos de Singapur ayudará a México a rastrear el origen y predecir las posibles mutaciones de la nueva cepa del virus de influenza A H1N1 de manera económica y rápida.

El chip de microarreglos -una serie de sondas de ADN unidas a un soporte sólido, que ayuda a determinar la expresión genética completa de un tejido-, creado por el Instituto Genómico de Singapur y la farmacéutica Roche, es usado por el Instituto Nacional de Medicina Genómica (Inmegen) para analizar el genoma completo del virus de pacientes infectados, lo que ayudará a detectar posibles cambios en la cepa, como una mayor virulencia o resistencia a los antivirales usados comúnmente."Esta es una oportunidad única para abrir canales de comunicación ante lo que será el próximo brote en la epidemia", dijo Edison Liu, director del Instituto Genómico del país asiático y líder de la comitiva que visitó México para acordar los términos de la colaboración entre ambas nacionesY es que aunque aún se desconoce cómo será el virus que se presente en el Hemisferio Norte el próximo invierno, los científicos deben estar atentos a la evolución de su genoma.Esto serviría para aislar a pacientes que presenten una versión más agresiva que la conocida, por ejemplo, o para tomar medidas más drásticas como cierre de fronteras o restricción de vuelos en caso de que aumente la virulencia del patógeno. "(Estos chips) permiten secuenciar todo el genoma del virus, lo que es muy útil para ver cambios en el genoma con relevancia clínica.Se seleccionarán muestras de los primeros casos, de la mitad de la epidemia y los actuales, para comparar la evolución del genoma y dónde están cayendo las mutaciones", explicó Alfredo Hidalgo, investigador del Inmegen, durante un recorrido por el laboratorio que alberga la nueva tecnología.Durante la etapa de detección y diagnóstico en el primer brote por el nuevo virus de influenza, los laboratorios realizaban pruebas que consistían en tomar fragmentos del genoma del virus, y con una combinación de sondas, obtener una respuesta positiva y negativa en torno a la nueva cepa. Esto se sigue haciendo en la mayoría de los países con casos de influenza, ya que se considera la "regla de oro" para el análisis genético del virus. Los nuevos chips, producidos bajo la tecnología Nimblegen, permitirán analizar el genoma completo del virus presente en pacientes con distintas historias clínicas: desde los que reaccionaron a los antivirales y no tuvieron que ser internados, hasta los que fallecieron. Un sólo experimento es capaz de analizar 12 muestras en 3 días, y el personal requerido para operar la tecnología es menor que en el método tradicional de secuenciación por PCR (Cadena en Reacción de la Polimerasa), lo que podría traer beneficios para países como México o China, donde la infraestructura de análisis no siempre es suficiente. "Incluso en países como China, que tiene varios centro de secuenciación, la tecnología es útil porque allí hay una población muy grande y vastas distancias", dice Liu, también Presidente de la Organización del Genoma Humano (HUGO). La gran ventaja de esta tecnología, explica Hidalgo Miranda, es que es mucho más rápida y más eficiente en cuanto a las personas necesarias para llevarlo a cabo.Una segunda tecnología, también elaborada por el Instituto Genómico de Singapur, consiste en un chip capaz de detectar 900 patógenos distintos vinculados o no con la influenza, lo que serviría para analizar si pacientes graves inicialmente diagnosticados con el nuevo virus también tienen otras infecciones que pudieron haber empeorado el cuadro clínico.Esto podría arrojar luz en torno a por qué algunos pacientes apenas sintieron los efectos del virus mientras que otros sucumbieron ante la infección en países como Estados Unidos, México y Argentina, que encabezan la lista de muertes por la epidemia. El Instituto Genómico de Singapur y Roche esperan distribuir las dos herramientas en países que lo requieran. Para hacerlo, preparan un kit que incluirá las pruebas de secuenciación y los chips. Hasta ahora, sólo México y la nación asiática han usado los nuevos chips. Hidalgo Miranda espera que la tecnología asiática eventualmente se use en otros institutos de investigación y diagnóstico en México, como el Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos (INDRE) o las universidades donde se realiza investigación, aunque aún no se ha confirmado su transferencia. Ayuda de la ciencia mexicanaEl análisis que un grupo de científicos de la UNAM encabezados por el biólogo Antonio Lazcano realizó durante la contingencia sanitaria por el nuevo virus de influenza ayudará a que el trabajo que realice el Instituto de Medicina Genómica tenga mayor proyección.Lazcano y otros 14 investigadores compararon y estudiaron las distintas secuencias de los genomas del virus A H1N1, encontrando datos clave sobre el origen de la cepa y su posible evolución genética.Este trabajo, dice el investigador del Inmegen Alfredo Hidalgo, demuestra que ambos grupos podrían trabajar en conjunto para continuar el rastreo del patógeno. "Si nosotros podemos contribuir con más secuencias para que ellos mejoren sus análisis, qué mejor binomio", opinó Hidalgo.